با عبور فاضلاب از روی بستر دارای لایه بیولوژیکی بخش قابل توجهی از مواد آلی به همراه اکسیژن مولکولی جذب این لایه می‌گردد. در آنجا اکسیداسیون بیولوژیکی هوازی افتاده و محصولات نهائی آلی و معدنی به لایه متحرک آب وارد می‌شوند. فاضلاب در عرض چند دقیقه از روی بستر صافی عبور می‌کند در حالیکه مواد آلی جذب شده به چندین ساعت زمان برای اکسیداسیون نیاز دارند. بخشی عمده‌ای از لایه بیولوژیکی تشکیل شده هوازی می‌باشد که این بخش لایه روئی را تشکیل می‌دهد، در بخش میانی و عمقی لایه بیولوژیک فعالیت‌ها بصورت غیر هوازی می‌باشد. با گذشت زمان ضخامت لایه بیولوژیکی بدیل تولید میکروارگانیسم‌های جدید ضخیم‌تر می‌گردد. و اینکار تا جائی ادامه می‌یابد که نهایتاً لایه بیولوژیکاز روی بستر کنده شود. (به این پدیده Slovghing گفته می‌شود). میزان حذف مواد آلی در بخش بالائی صافی بیشتر و در بخش پائین کمتر است. رشد باکتری‌های نیتریفای در بخش پائینی صافی بیشتر می‌باشد.

با توجه به اینکه با هر بار عبور فاضلاب از روی صافی اجازه می‌دهد میکروب‌ها فرصت رژیم هیدرولیکی جریان در صافی‌های چکنده به علت عبور فاضلاب از کانال‌های باریک، دراز و غیر یکنواختی که بین مصالح بستر صافی ایجاد می‌شود یه حالت نهر گونه بسیار نزدیک است.